È l'autore di Cercando Alaska, Teorema Catherine, Città di carta e Colpa delle stelle, tutti pubblicati da Rizzoli.
I suoi romanzi si sono aggiudicati molti riconoscimenti, tra cui la Printz Medal (il premio attribuito dai bibliotecari americani alla letteratura YA) e l'Edgar Award.
John È stato due volte finalista al LA Times Book Prize e la rivista TIME l'ha inserito nell'elenco delle cento persone più influenti del mondo.
Con il fratello Hank ha cofondato Vlogbrothers, uno dei canali video più seguiti al mondo.
Vive con la sua famiglia a Indianapolis, Indiana.